锦鲤的运输很简单，只要放入塑胶袋充氧即可。幼鱼或中型鱼可以自行搬运，但大型鱼常由业者代为运送。新鱼带病菌或寄生虫的危险性大，处理不好时，常会使健康鱼受到感染。因此，运输用水应加入食盐与抗生素为宜。锚头鱼蚤与鲺子肉眼可见，如发现，必须马上除掉并消毒伤口。最重要的是调整水温。
一般业者池水比爱好者的池水温度高。如水温相差5℃以上，鱼易感冒，进而引发其他疾病。因此，外来的锦鲤不能马上放入池中，而应将装鱼的塑胶袋放入水池中半小时左右，待袋内外水温相等时再解开塑胶袋，将鱼放入水池。因为业者与爱好者池水水质不同，因此将鱼直接放人池中会引起新水病，即鱼体消瘦、胸鳍或尾鳍腐烂等。除了调整水温外，还应该让池水慢慢流入塑胶袋内，使鱼渐渐习惯不同水质，然后放入池中。最好这时加入适量食盐浸浴，可以防止病菌的侵人。鱼池及过滤系统做好后，必须先去除水泥碱，试水后才能养鱼。鱼池的日常管理，主要注意保持池水清洁，如有鱼的排泄物或残余饵料、树叶等，须尽早清除。
一般最好每天排底水1次，过滤槽亦需1周左右清除1次池底污泥，排出污水，同时排出水中对鱼有害的物质，保持良好的水质是水池管理上最重要的一点，也是养好锦鲤的关键。
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