滴虫常寄生在女性生殖器内，称为阴道滴虫。感染多为男女性生活后的交互感染，所以，泌尿道滴虫病的治疗应是夫妻双方同时进行。
女性在治疗过程中应避免性生活，可采用阴道冲洗及阴道内放入灭滴灵的方法。也可用阿沙霉素1～2片塞入阴道（每日1次）。
对泌尿道及男性生殖器的滴虫感染可用以下方法治疗：
①甲硝唑（灭滴灵），每次400mg，每日3次口服，10天为1疗程。间隙2～4周后，再给与第2个疗程（共3个疗程）。
②金霉素，前3天可每日3克，第4～8天每日2克，分4次服用（此药可单独服用，也可与灭滴灵合用）。
③卡巴胂，每次0.25g，每日2次，服用7天。
④可用中药黄连解毒汤（黄连9克，黄芩6克，黄柏6克，栀子9克）配合治疗。
⑤在服用灭滴虫药的同时也要应用一些治疗泌尿系感染的药物，如氟哌酸、环丙氟哌酸、呋喃口旦啶等，较重的感染要根据尿培养细菌对药物的敏感结果选择有效抗生素。
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