侯安都，始兴曲江人，是始兴的豪门大族，侯安都年轻时博学多才，善长隶书、五言诗。在音律方面也是很有研究，武艺高强，当时乡里人都觉得他以后有一番成就。始兴内史萧子范听闻他的才能，就聘请他为主簿，这算是他正式出道了。
侯景作乱的时候，始兴太守陈霸先起兵援救建康，这时侯安都趁机拉起了一支三千人的队伍，前去投奔陈霸先，两人就开始组队了。陈霸先首先兵发南康进屯西昌，侯安都随陈霸先征战，攻破蔡路养、李迁仕，最后顺利平定了侯景之乱。这次平乱有功，侯安都被封为猛烈将军，随陈霸先镇守京口，任兰陵太守。
王僧辩畏惧北齐给的压力，准备拥立萧渊明为帝，使梁国成为北齐的附属国，这一举动遭到了陈霸先的反感，陈霸先准备谋袭王僧辩，这事陈霸先只和侯安都商议，其余诸将都不曾告知。两人商量好要杀王僧辩的，在快到王僧辩驻地的时候，陈霸先打起了退堂鼓，这回就真吓到侯安都了。
于是他大骂陈霸先，既然选择了反叛，这已经成了事实，如今生死关头你打退堂鼓，你以为后退了就能保证不被杀吗？陈霸先被骂的狗血淋头，觉得侯安都说的对，就继续带兵前进。到了石头城，侯安都便披甲带长刀，让手下将其捧起，把他丢到城内，军士相继而入，直逼王僧辩卧室。陈霸先也率步骑从南门入城，缢杀王僧辩父子。
陈霸先杀了王僧辩父子后，就废黜萧渊明，拥立萧方智为帝。由于侯景之乱给南朝带来的伤害实在是太大，所以这时拥立的皇帝仍然在北齐面前称藩。侯安都因功被封为仁威将军、南徐州刺史。王僧辩被杀后，他的旧部起兵反陈霸先。震州刺史杜龛与义兴太守韦载、吴郡太守王僧智等据城抗陈霸先。
陈霸先准备东征，平定王僧辩的旧部，命侯安都镇守大本营台城，这时徐嗣徽暗降北齐。趁着陈霸先东征，就秘密与豫州刺史任约通气，派了精兵五千偷袭建康，并且占据了石头城，进逼台城。侯安都下令关闭城门偃旗示弱，双方僵持到了晚上，徐嗣徽收兵回石头城，准备明天强攻台城。当晚侯安都令士卒暗中打造御敌器具，第二天一大早，徐嗣徽率领大军来攻。侯安都率三百勇士开东西掖门出战，大破徐嗣徽，徐嗣徽逃回石头城，从此不敢进逼台城。
不久陈霸先班师收回建康，准备包围石头城，北齐派遣士兵渡江占据姑孰，来援救徐嗣徽、任约。并准备向石头城送食物以及装备。这事被陈霸先得知后，随即让侯安都率水军夜袭北齐援军，烧毁北齐船只千余艘，断了北齐的粮运。
侯安都又偷袭秦郡，大败徐嗣徽，陈霸先围攻石头城，断了城中水源，几天以后因城中缺水。因缺水导致军心不稳，北齐大将柳达摩无奈只好派遣使向陈霸先求和，陈霸先随即与北齐结盟，签订互不侵犯和约。徐嗣徽、任约跟随柳达摩投奔北齐去了。
没过多久，北齐违背和约进攻南梁，派遣萧轨、任约、徐嗣徽合兵十万向梁山进攻，被梁守将黄丛击败，陈霸先又遣部将沈泰至侯安都处加强防御。侯安都则率轻装兵士袭击北齐军，历阳一战，斩杀一万多北齐士兵。
侯安都与北齐大将王敬宝在龙尾大战，派他的第弟侯晓、军主张纂为先锋攻打王敬宝的阵营，冲阵的时候，侯晓中枪坠马，张纂战死。侯安都单骑来救侯晓，并斩杀了北齐军骑兵十几人，兄弟二人扛着张纂尸体退走，北齐军被侯安都的勇猛吓到了，都不敢进他的身，任凭他兄弟两冲出阵营。
决战前夕，侯安都鼓励部将萧摩诃，听说你骁勇善战，千闻不如一见。萧摩诃说道，今天就让将军见识，双方大战时，侯安都受伤落下马来，被北齐军包围，萧摩诃看见后，单枪匹马前去救侯安都，直冲北齐军，所向披靡，无人可挡，侯安都被萧摩诃所救。在和陈霸先前后包夹之下，北齐军大败，被斩杀数千人，北齐军主帅萧轨被俘虏。
萧勃不满陈霸先总揽朝廷大权，于是在广州举兵反叛陈霸先，陈霸先命侯安都帮助周文育讨伐萧勃，侯安都到的时候，萧勃已被斩杀，只剩萧孜在河流两岸布下阵势，侯安都于是包围萧孜，萧孜在突围无望的情况下只能投降。
陈霸先受禅称帝，王琳拒绝臣服陈霸先，于是命侯安都征讨王琳。这一战侯安都被生擒，交给宦官王子晋看守，王子晋贪财，侯安都许诺只要王子晋放了他，会给他更多的钱财，王子晋悄悄把他放了。回到南陈后，陈霸先并没有怪罪他，让他出任镇西将军、南豫州刺史。
陈霸先病死的时候，他的儿子陈昌还在北周做人质，于是侯安都便拥立陈霸先的侄子临川王陈蒨为帝，是为陈文帝，当时陈霸先的皇后不同意陈蒨为帝，要等儿子陈昌来，侯安都用武力逼迫众人，陈蒨才当上了这个皇帝，这也为他的死埋下伏笔。
北周想让陈昌回去即位称帝，这时的南陈皇帝陈蒨故意对侯安都说，陈昌回来了，我要找个地方养老了。然后派侯安都去接陈昌，陈昌在回来渡过汉水的时候，被侯安都推下汉江而死。回来后侯安都进爵为清远郡公，次年又大败王琳，也算是为自己被生擒找回了场子。
自从平定王琳后，侯安都觉得自己在南陈功劳最大，做事也越来越放肆，这就惹得陈文帝相当不高兴，而且经常聚集上千人都文臣武将在他的府邸。这动静搞的比皇宫还热闹，真正让他丧命的事件，是一次他和陈文帝喝酒，于是追问陈文帝，现在当了皇帝了，比当初临川王的时候感觉如何，陈文帝不想回答，但侯安都不依不饶的还在追问，“文帝无奈，只得答道：“这虽是天命，也多亏了侯公的帮助”。
这事过后没多久，文帝又设宴请侯安都，这次直接就想宴席上抓捕了侯安都，并赐死了侯安都。有勇有谋的侯安都，他最大的缺点就是个性张扬，当时陈霸先就提醒过他，只是后来想着自己功劳最大，目中无人，这才给自己召来杀身之祸。
