泉州市疫情源头是奥密克戎变异株(BA.2)进化分支。虽然说我国多地引发的本土疫情都和奥密克戎变异株分支有关，但经国家疾控中心分析，在国内已知新冠病毒序列中，未能找到福建此次疫情高度同源序列。所以很有可能是境外输入引起的，而值得注意的是，厦门核酸测序结果与龙岩市、漳州角美的病例不同源。
可能和境外输入引起有关。泉州是我国港口城市之一，泉州港就位于泉州市境内，东南晋江下游滨海的港湾，区域北至泉州湄洲湾内澳，南至泉州围头湾同安区莲河。共有装箱航线108条，其中外贸线30条，内贸线78条。而港口城市，最大的隐患就境外输入，导致港口从业人员存在感染风险。
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